姓    名

胡岳  

性    别

男

籍    贯

山东济南

出生年月

1988年8 月  

职    称

讲师

政治面貌

中共党员

专    业

生物信息学

职    务

无

导师类别

无

学历、学位

博士研究生

课 题 组

  生物医学(IVD)研究所

工作信息

电话：18866123925 邮箱：huyue@qlu.edu.cn

隶属单位

   齐鲁工业大学（山东省科学院）生物工程学部

通讯地点

   山东省济南市长清区大学路3501号齐鲁工业大学

学习、工作简历：

中国科学技术大学生物信息学博士毕业。以第一和共同第一作者发表SCI论文多篇。与张亚平院士，施蕴渝院士,刘海燕教授等有合作。主要研究方向：生物信息学，宏基因组学，体外诊断试剂盒的开发，高通量测序技术方法与应用，基于人工智能的蛋白质和抗体设计方法与应用。正在研发有自主知识产权的人工智能抗体设计软件AlphaPanda2.0。目前担任山东生物信息学会理事，山东省医药生物技术学会生物标记与体外诊断技术专业委员会委员，担任多本学术（SCI）期刊的青年编委。目前开发的程序：https://github.com/YueHuLab/

近年来，我们致力于人工智能 + 生物医药的前沿研究，为了促进学术界和工业界的广泛应用，我们已将所有人工智能相关的程序代码完全开源。实验室在该领域仍然有领先优势，我们还有未发表的最优模型和最优模型参数，这些模型和参数凝聚了我们的深度优化和创新成果，使得我们的 AI 方法在性能、准确性和适应性方面均达到更高水平。我们热忱欢迎学术界和工业界与我们合作交流，共享这场人工智能与生物医药的创新盛宴。期待与各界携手，共同推动这一领域迈向更高的智慧高地！

同时，欢迎感兴趣并专业相关（人工智能、生物信息学、计算生物学等专业）本科生到实验室实习：huyue@qlu.edu.cn

人工智能的抗体设计软件AlphaPanda1.0已经在中科院SCI一区Journal of Pharmaceutical Analysis杂志（2024年中国最具国际影响力期刊，中国卓越期刊）在线正式发表。

Yue Hu, Feng Tao, Jiajie Xu, WenJun Lan, Jing Zhang, Wei Lan, Combining transformer and 3DCNN models to achieve co-design of structures and sequences of antibodies in a diffusional manner, Journal of Pharmaceutical Analysis, 2025, 101267, ISSN 2095-1779, https://doi.org/10.1016/j.jpha.2025.101267.

结合经典遗传学原理利用蛋白质语言模型零样本检测圆突变方法，已经发表在国际知名期刊Computational and Structural Biotechnology Journal 杂志。

Hu, Yue, Bin Huang, Chun Zi Zang, and Jia Jie Xu. Detection of circular permutations by Protein Language Models. Computational and Structural Biotechnology Journal 27 (2025): 214-220.

教育经历：

(1) 2010-09 至 2015-07, 中国科学技术大学, 生物信息学, 博士

(2) 2006-09 至 2010-07, 曲阜师范大学, 生物科学, 学士

教学、科研与学术工作经历（博士后工作经历除外）：

(1) 2015-10 至 今, 齐鲁工业大学（山东省科学院），生物工程学院&基辅学院，生物技术系，讲师

主要研究方向：

人工智能的抗体药物设计，人工智能的蛋白质设计，蛋白质结构比对，蛋白质docking，蛋白质分子动力学模拟，中药网络药理学，高通量测序方法和应用，表观遗传学，体外诊断试剂盒研发等生物信息学、生物制药和生物医学工程等领域。

本科和研究生主要授课课程：

《生物信息学》、《生物统计学》、《遗传学》等。

近五年参加的国家自然科学基金项目/课题：

(1) 国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目, 31800062, 形态转换调控因子Wor1在球孢白僵菌中的生物学功能及其作用机理研究, 2019-01-01 至 2021-12-31, 25万元, 结题, 参与

(2) 国家自然科学基金委员会, 青年科学基金项目, 81703941, 5-HT3R与CB1R协同介导情绪调控脑区GABA释放在PMDD肝气逆郁两证中的作用, 2018-01-01 至 2020-12-31, 20万元, 结题, 参与

近五年主持或参加的其他科研项目/课题：

(1) 山东省自然科学基金委员会, 博士基金, ZR2016HB54, 中药网络药理学的方法改进拓展及在“四逆

散” 研究中的应用, 2016-11 至 2018-11, 7万元, 结题, 主持

（2）山东省教育厅, 山东省高等学校青年创新团队发展计划, 2022KJ127, 生防真菌新型调控因子的功能解析及应用研究, 2023-01 至 2025-12, 50万元, 在研, 参与

（3）山东省科技厅, 山东省自然科学基金面上项目, ZR2023MC035, 球孢白僵菌Tudor 结构域蛋白调控孢子大小及侵染毒力的作用机制研究, 2024-01 至 2026-12, 10万元, 在研, 参与

代表论文（一作和共一作）：

（1）Yue Hu, Feng Tao, Jiajie Xu, WenJun Lan, Jing Zhang, Wei Lan, Combining transformer and 3DCNN models to achieve co-design of structures and sequences of antibodies in a diffusional manner,  Journal of Pharmaceutical Analysis, 2025, 101267, ISSN 2095-1779, https://doi.org/10.1016/j.jpha.2025.101267.（共一作者，，兰文军教授，张静副教授）

（2）Hu, Y., Huang, B., Zang, C. Z., & Xu, J. J. (2024). Detection of circular permutations by Protein Language Models. Computational and Structural Biotechnology Journal. （共一作者，共同通讯，黄斌教授）

（3）Li CY, Yang P, Zheng J, Zhang J, Liu YQ, Liu XQ, Hu Y, Lan WJ. Establishment of a forward primers-superposed amplification analysis for accurate aspirin pharmacogenomic measurement. Sci Rep. 2024 Jan 9;14(1):880. （共同通讯，兰文军教授）

（4）Zhong-Yin Zhou; Yue Hu; Aimin Li; Ying-Ju Li; Hui Zhao; Si-Qi Wang; Newton O. Otecko;Dejiu Zhang; Jin-Huan Wang; Yajun Liu; David M. Irwin; Yan Qin; Ya-Ping Zhang ; Genome wide analyses uncover allele-specific RNA editing in human and mouse, Nucleic Acids Research, 2018, 17(46): 8888-8897（共一作者，张亚平院士通讯）

（5）Hu, Yue; Hong, Wei; Shi, Yunyu; Liu, Haiyan ; Temperature-Accelerated Sampling andAmplified Collective Motion with Adiabatic Reweighting to Obtain Canonical Distributions andEnsemble Averages., J Chem Theory Comput, 2012, 8(10): 3777-3792 （一作，施蕴渝院士、刘海燕教授）

（6）Hu, Yue; Liu, Haiyan ; Case study on temperature-accelerated molecular dynamicssimulation of ligand dissociation: inducer dissociation from the Lac repressor protein., J PhysChem A, 2014, 118(39): 9272-9279 （一作，刘海燕教授）

预印版文章（一作或通讯）：

(1)Hu Y, Huang B. Comprehensive Database of Circular Permutations: Systematic Detection and Analysis Using Deep Learning. bioRxiv. 2024:2024-08.

参与论文与专利：

（1）Yu Xia; Pengjun Liu; Xiaoquan Liu; Jing Zhang; Xinfeng Tan; Xuli Jia; Yuemei Jin; TaoLiu; Yue Hu ; Complete organellar genomes and molecular phylogeny of Hypnea cervicornis(Gigartinales, Florideophyceae) from China, Journal of Applied Phycology, 2022, 34: 2705-2717

（2）师声; 张静; 胡岳; 刘义庆; 褚福禄; 兰文军 ; 锁核酸和不对称扩增辅助的等位基因多重引物识别KRAS基因突变的研究, 齐鲁工业大学学报, 2022, 36(5): 55-61 (期刊论文)

（3）兰文军; 张静; 胡岳 ; 单碱基连续延伸流式靶向测序法, 2022-11-25, 中国,CN201911165464.7 (专利)

（4）Yang, P., Su, Q., Hu, Y., Zhang, J., & Lan, W. Screening and Validation of Double Allele-specific Binding F-Primers for Measurement of Anti-Hypertension Pharmacogenomics. Frontiers in Medicine, 10, 1269221.

参与著作章节：

（1）Hu Y, Lan W, Miller D. Next-generation sequencing for MicroRNA expression profile[J]. Bioinformatics in MicroRNA Research, 2017: 169-177. （引用53次）

（2）Hu Y, Lan W, Miller D. Handling high-dimension (high-feature) microrna data[J]. Bioinformatics in MicroRNA Research, 2017: 179-186.

（3）Hu Y, Lan W, Miller D. Exploring MicroRNA:: Target Regulatory Interactions by Computing Technologies[J]. Bioinformatics in MicroRNA Research, 2017: 123-131.

开发的软件和代码：

（1）人工抗体设计软件AlphaPanda： https://github.com/YueHuLab/AlphaPanda

(2) 蛋白质circularpermutation挖掘软件plmCP：https://github.com/YueHuLab/plmCP

（3）蛋白质circularpermutation数据库：  https://github.com/YueHuLab/Circular-permutation-in-PDB

科研获奖：

无

人才称号和荣誉：

无

社会兼职：

期刊工作经历：

担任iMeta杂志青年编委（SCI杂志，影响因子23.7分）

担任Interdisciplinary Sciences：Computational Life Sciences 的青年编委 （SCI杂志，中科院二区）

担任Oncology Research 的Review Editor （SCI杂志）

担任Phenomics（金力院士主编），AROH（Animal Research & One Health 动物研究与健康），Biomedical Engineering Communications，Food & Medicine Homology的青年编委（国产潜力期刊）

担任Biocell杂志（SCI）审稿人

担任《生物医学工程研究》编委

担任《河南理工大学学报》青年编委

学会组织：

山东生物信息学会理事

山东省医药生物技术学会生物标记与体外诊断技术专业委员会委员

上海市生物信息学会会员

山东生物医学工程学会会员

人民团体：

长清区青年联合会第四届委员会常务委员